Genomic reagents selection guide
Ассортимент реагентов для геномных исследований компании Beckman Coulter основывается на технологии обратимой твердофазной иммобилизации (SPRI), которая хорошо известна благодаря применению в нашем наборе Agencourt AMPure XP, в котором используются парамагнитные частицы для селективного связывания нуклеиновых кислот по типу и размеру. Благодаря технологии обратимой твердофазной иммобилизации наши химические реагенты реализуют высокоэффективные протоколы выделения и очистки в таких областях применения, как количественная ПЦР, цифровая капельная ПЦР, секвенирование по Сэнгеру, секвенирование нового поколения (NGS) и микроматричный анализ.
Чтобы узнать, поддерживают ли имеющиеся наборы ваши ручные или автоматизированные процессы пробоподготовки, ознакомьтесь с приведенной ниже таблицей для некоторых исходных материалов. Следует отметить, что список возможных исходных образцов не ограничивается образцами, указанными в таблице ниже.
| ИСХОДНЫЙ МАТЕРИАЛ | ВЫДЕЛЕНИЕ ОБЩЕЙ НК | ВЫДЕЛЕНИЕ ДНК | ВЫДЕЛЕНИЕ РНК | ОЧИСТКА | ||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| ОБРАЗЦЫ МЛЕКОПИТАЮЩИХ | ||||||||||||||
| Буккальные мазки |
|
|
||||||||||||
| Зафиксированные формалином и залитые парафином (FFPE) ткани |
|
|
|
|||||||||||
| FTA карты/сухие пятна крови |
|
|||||||||||||
| Пробирки для сбора слюны OrageneTM |
|
|
||||||||||||
| Пробирки для сбора слюны NorgenTM |
|
|||||||||||||
| Пробирки для сбора слюны OracollectTM Saliva Collection Tubes |
|
|||||||||||||
| Плазма |
|
|
||||||||||||
| Сыворотка |
|
|||||||||||||
| Свежая или замороженная ткань |
|
|
|
|||||||||||
| Цельная кровь |
|
|
||||||||||||
| Образцы крови PAXGene |
|
|
||||||||||||
| Молоко |
|
|||||||||||||
| Слюна, смывы ротовой полости |
|
|||||||||||||
| КУЛЬТУРЫ КЛЕТОК | ||||||||||||||
| Адгезионные и неадгезионные |
|
|
||||||||||||
| Большое количество клеток (до 4 миллионов) |
|
|||||||||||||
| Первичные клетки (например мононуклеарные клетки периферической крови) |
|
|
|
|
||||||||||
| БАКТЕРИИ И ГРИБЫ | ||||||||||||||
| E. coli |
|
|
|
|||||||||||
| Pseudomonas |
|
|
||||||||||||
| Staphylococcus aureus |
|
|
||||||||||||
| Klebsiella pneumoniae |
|
|||||||||||||
| Candida albicans |
|
|||||||||||||
| Neurospora intermedia |
|
|||||||||||||
| ПЛАЗМИДЫ | ||||||||||||||
| Искуственные бактериальные хромосомы (BACs), космиды, фосмиды |
|
|||||||||||||
| ВИРУСЫ | ||||||||||||||
| Вирус простого герпеса второго типа (HSV-2) |
|
|||||||||||||
| Вирус хронического гепатита C |
|
|
|
|||||||||||
| ДРУГИЕ ОБРАЗЦЫ | ||||||||||||||
| Кровь птиц |
|
|||||||||||||
| Насекомые (например Drosophila) |
|
|
||||||||||||
| Рыбы (например Данио полосатый) |
|
|
||||||||||||
| Водные беспозвоночные |
|
|||||||||||||
| ОБРАЗЦЫ НУКЛЕИНОВЫХ КИСЛОТ | ||||||||||||||
| Синтез кДНК |
|
|||||||||||||
| Удаление терминирующих красителей |
|
|||||||||||||
| Транскрипция инвитро |
|
|
||||||||||||
| Этапы сборки библиотек для NGS |
|
|
|
|||||||||||
| Продукты ПЦР |
|
|||||||||||||
|
|
Валидирован и полностью поддерживается | |||||||||||||
|
|
Продемонстрирована работа, получены данные и/или используется альтернативный протокол | |||||||||||||
|
|
Опробовано заказчиком, получены данные | |||||||||||||
